Да, это полновесная замена бэкапам огромных gcf-файлов. Патчи весят десятки метров, а не гигабайты.
Как работает: человек, которому нужны патчи для своих gcf-ок запускает CFToolbox, делает для своих файлов "архивы". Насколько я понимаю, это файлы, в которых содержится информация, какая версия файла и что содержится в нем. Этот архив он отсылает другому человеку, у которого есть полностью пропатченная версия. Этот человек на основании этого архива и своего пропатченного gcf-файла делает патч с версии X на версию Y. Не очень удобно в том плане, что нельзя сделать кумулятивный патч, но это лучше, чем качать гигы балласта.